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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
27/10/2011 |
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Data da última atualização: |
07/10/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
GUERRA, R. L.; ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; GOULART, C. de C. |
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Afiliação: |
RAFAEL LUCIANO GUERRA, UFV; SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; CARLOS DE CASTRO GOULART, UFV. |
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Título: |
Um software para extração de ESTs, CONTIGS e SINGLETS do CAFEST. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Uma das dificuldades encontrada atualmente para os usuários da base de dados do Projeto Brasileiro do Genoma Café (CafEST) é a dificuldade em extrair manualmente todas as sequências armazenadas em seus projetos, no sistema Gene Projects. A partir dessa necessidade, foi desenvolvido um software para fazer a automatização do processo. Desta forma, o usuário do CafEST passa a dispor da comodidade de apenas informar ao programa quais projetos ele deseja que tenham as ESTs, contigs ou singlets extraídos. O programa consiste em dois scripts, um para fazer a extração das ESTs e outro para fazer a extração dos contigs e dos singlets. Os dois scripts retiram do CafEST apenas as ESTs, os contigs e singlets e salvam cada um desses em um arquivo do tipo FASTA. Isto facilita o uso dos mesmos em outras bases de dados e/ou ferramentas de bioinformática |
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Palavras-Chave: |
ESTs; Genoma café; Programação Script. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/44673/1/Um-software-par-extracao.pdf
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Marc: |
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520 $aUma das dificuldades encontrada atualmente para os usuários da base de dados do Projeto Brasileiro do Genoma Café (CafEST) é a dificuldade em extrair manualmente todas as sequências armazenadas em seus projetos, no sistema Gene Projects. A partir dessa necessidade, foi desenvolvido um software para fazer a automatização do processo. Desta forma, o usuário do CafEST passa a dispor da comodidade de apenas informar ao programa quais projetos ele deseja que tenham as ESTs, contigs ou singlets extraídos. O programa consiste em dois scripts, um para fazer a extração das ESTs e outro para fazer a extração dos contigs e dos singlets. Os dois scripts retiram do CafEST apenas as ESTs, os contigs e singlets e salvam cada um desses em um arquivo do tipo FASTA. Isto facilita o uso dos mesmos em outras bases de dados e/ou ferramentas de bioinformática
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/09/2013 |
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Data da última atualização: |
12/09/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CRUZ, M. A.; RORIZ, A. K. P.; BRAVO, I. S. J.; NASCIMENTO, A. S. do; SELIVON, D. |
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Afiliação: |
MAIARA ALEXANDRE CRUZ, UFRB; ALZIRA KELLY PASSOS RORIZ, UFBA; IARA SORDI JOACHIM BRAVO, UFBA; ANTONIO SOUZA DO NASCIMENTO, CNPMF; DENISE SELIVON, USP. |
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Título: |
Estabelecimento de colônias de Anastrepha obliqua (Diptera: Tephritidae) baseada em características morfológicas externas. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 7., 2013, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2013. Publicação online. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O gênero Anastrepha é um amplo táxon que apresenta distribuição tropical e subtropical, onde as espécies inseridas, nesse gênero, causam grandes prejuízos à fruticultura nacional. Dentre essas, as de maior importância econômica são A. obliqua Macquart e A. fraterculus (Wiedemann). A colonização de A. obliqua em laboratório pode servir a vários propósitos que vão desde pesquisa básica até extensos programas de controle, como por exemplo: a técnica do inseto estéril (TIE). |
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Palavras-Chave: |
Moscas das frutas; Padronização metodológica. |
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Thesagro: |
Anastrepha; Criação Massal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/89309/1/Estabelecimento-de-colonias-095-13-Maiara-ANascimento.pdf
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Marc: |
LEADER 01273nam a2200205 a 4500
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100 1 $aCRUZ, M. A.
245 $aEstabelecimento de colônias de Anastrepha obliqua (Diptera$bTephritidae) baseada em características morfológicas externas.
260 $aIn: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 7., 2013, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2013. Publicação online.$c2013
520 $aO gênero Anastrepha é um amplo táxon que apresenta distribuição tropical e subtropical, onde as espécies inseridas, nesse gênero, causam grandes prejuízos à fruticultura nacional. Dentre essas, as de maior importância econômica são A. obliqua Macquart e A. fraterculus (Wiedemann). A colonização de A. obliqua em laboratório pode servir a vários propósitos que vão desde pesquisa básica até extensos programas de controle, como por exemplo: a técnica do inseto estéril (TIE).
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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